مجله به‌زراعی نهال و بذر مقالات تحقیقی و نتایج تحقیقات در زمینه علوم وابسته به به‌زراعی و فیزیولوژی گیاهان زراعی و باغی که به زبان فارسی نوشته شده و قبلاً به هیچ طریق انتشار نیافته و یا همزمان به مجلات دیگر فرستاده نشده باشند را با داوری علمی و ادبی پذیرفته و منتشر می‌کند. مقالاتی که خلاصه آنها در مجامع علمی داخلی و خارجی ارائه و چاپ شده باشد، مستثنی هستند. مقالات در زمینه‌های آگرونومی (به‌زراعی) و اکوفیزیولوژی (تنش‌های محیطی غیرزنده، تغذیه گیاهی و موارد مشابه) گیاهان زراعی و باغی که شرایط محیطی بر نتایج آن‌ها تاثیر قابل ملاحظه‌ای دارد، باید حداقل نتایج دو تا سه سال و یا محیط‌های مختلف (با توجه به موضوع تحقیق) را ارائه کنند. نتایج حاصل از اجرای یک سال یا در یک محیط این قبیل تحقیقات پذیرفته نمی‌شود.